良性肿瘤和恶性肿瘤在生物学特性和对机体的影响上有明显不同。
良性肿瘤一般对机体影响小，易于治疗，疗效好；恶性肿瘤危害较大，治疗措施复杂，疗效也不够理想。
良性肿瘤与恶性肿瘤间有时亦无绝对界限，我们将组织形态和生物学行为介于上述良恶性之间的某些肿瘤，称为交界性肿瘤(borderline tumor)。它们可表现为局部复发，但常不发生转移。如卵巢交界性浆液性乳头状囊腺瘤和交界性粘液性囊腺瘤，中间型血管内皮瘤等。此类肿瘤多次复发后可逐渐向恶性发展。
恶性肿瘤的恶性程度也各不相同，有的较早发生转移，如鼻咽癌；有的转移较晚，如子宫体腺癌；有的几乎不发生转移，如皮肤的基底细胞癌。
良性肿瘤与恶性肿瘤的区别
| 良性肿瘤 | 恶性肿瘤 | |
| 组织分化程度 | 分化好，异型性小，与原有组织的形态相似 | 分化不好，异型性大，与原有组织的形态差别大 |
| 核分裂像 | 无或稀少，不见病理核分裂像 | 多见，并可见病理核分裂像 |
| 生长速度 | 缓慢 | 较快 |
| 生长方式 | 膨胀性或外生性生长，前者常有包膜形成，与周围组织一般分界清楚，故通常可推动包膜形成 | 浸润性或外生性生长，前者无包膜，一般与周围组织分界不清楚，通常不能推动，后者常伴有浸润性生长。 |
| 继发改变 | 很少发生坏死、出血 | 常发生出血、坏死、溃疡等 |
| 转移 | 不转移 | 常有转移 |
| 复发 | 手术切除后很少复发 | 手术切除等治疗后较多复发 |
| 对机体影响 | 较小，主要为局部压迫或阻塞作用。如发生在重要器官也可引起严重后果 | 较大，除压迫、阻塞外，还可以破坏原发处和转移处的组织，引起坏死、出血、合并感染，甚至造成恶病质 |
此外，肿瘤的良恶性也并非一成不变，某些良性肿瘤如不及时治疗，可转变为恶性肿瘤，称为恶变(malignant change)，如结肠乳头状腺瘤可恶变为腺癌。而极个别的恶性肿瘤(如黑色素瘤)，有时由于机体免疫力加强等原因，可以停止生长甚至完全自然消退。儿童的神经母细胞瘤(neuroblastoma)的瘤细胞有时能发育成为成熟的神经细胞，甚至转移灶的瘤细胞也能继续分化成熟，使肿瘤停止生长而自愈。但这种情况必竟是极少数，绝大多数恶性肿瘤不能自然逆转为良性。